Nell'intestino tenue, vengono infine prodotti due enzimi, la peptidasi e la maltasi, che completano definitivamente la digestione delle proteine in aminoacidi (la peptidasi), e dell'amido in glucosio (la maltasi). Aminoacidi e glucosio sono molecole piccole, che possono passare attraverso i villi intestinali.

I peptidi, risultato della prima fase della digestione delle proteine, vengono digeriti in aminoacidi dall'azione dell'enzima peptidasi:

Il maltosio, un disaccaride risultato della prima fase della digestione dell'amido, viene digerito in glucosio dall'enzima maltasi:

Se il maltosio ha il proprio enzima, la maltasi, che ne permette la digestione completa in glucosio, ciascun disaccaride (es. il lattosio ed il saccarosio) trova, nell'intestino tenue, il proprio enzima che ne consentirà la completa digestione.

Nella seguente tabella sono riportati i principali enzimi digestivi prodotti dall'apparato digerente.